单细胞表观基因组学(ATAC v2)解决方案

为什么选择Epi ATAC？

仪器运行时间：18分钟

捕获细胞数：每个通道可以达到1万，每张芯片8分钟可以检测8万个细胞

细胞捕获效率：最多65%的捕获效率

多胞率：每1000个细胞0.8%

线粒体基因占比：小于2%

兼容样本类型：从细胞系、组织解离细胞、速冻组织提取的细胞核

兼容物种：大多数的真核生物(鸟类、哺乳类、植物等)
细胞核的转座酶处理时间：30分钟
分析内容：分析单细胞分辨率的染色质开放性、基于开放染色质区和富集转录因子(TF)基序的细胞聚类和鉴定、结合数据库分析基因之间的调控关系和信号通路

案例分享：

下图为人的PBMC样本获得的细胞核，使用ATAC V2试剂检测，目标捕获10000个细胞核。最终测序结果中检测到了10273个细胞核，细胞核中检测到的高质量的DNA片段中位数为20046。t-SNE图展示了细胞聚类和每个细胞核中高质量DNA片段的分布。
数据链接：
https://www.10xgenomics.com/datasets/10k-human-pbmcs-atac-v2-chromium-x-2-standard