单细胞多组学(GEM-X Multiome - ATAC+ RNAseq v2.0)解决方案

仪器运行时间：6分钟

捕获细胞数：每个通道可以达到2万，每张芯片8分钟可以检测16万个细胞

细胞捕获效率：最多80%的捕获效率

多胞率：每1000个细胞0.4%

多组学分析：可同时检测同一细胞中的ATAC和RNA

线粒体基因占比：小于2%

细胞核的转座酶处理时间：30分钟

兼容样本类型：从细胞系、组织解离细胞、速冻组织提取的细胞核

兼容物种：大多数的真核生物(鸟类、哺乳类、植物等)

分析内容：分析单细胞分辨率的染色质开放性、基于开放染色质区和富集转录因子(TF)基序的细胞聚类和鉴定、结合数据库分析基因之间的调控关系和信号通路

高效稳健的工作流程。借助全程提供技术支持的文库构建工作流程和成套试剂来简化实验操作，为同时检测同一单细胞的基因表达和ATAC-seq数据提供了强大的解决方案。

数据基准测试
自2020年Chromium Next GEM Epi Multiome ATAC + Gene Expression检测试剂首次商业化发布以来，该技术已被广泛采用，相关数据已发表于300余篇同行评审文献中，涉及肿瘤学、神经科学、发育生物学和免疫学等多个研究领域。下方展示的数据来自人脑样本，分别使用Next GEM Epi Multiome ATAC + Gene Expression和新一代GEM-X Epi Multiome检测试剂进行处理。数据显示，以每个细胞核检测到的中位基因数和中位UMI数衡量的基因表达灵敏度，在使用GEM-X Epi Multiome检测试剂处理的样本中显著提升；而以每个细胞核的中位独特片段数衡量的ATAC灵敏度则表现相近。在包括人肺、人前列腺癌、小鼠脑和小鼠肺在内的多种组织类型中，均观察到相似的基因表达和ATAC性能趋势。

GEM-X Epi Multiome在保持与Next GEM Multiome相近ATAC灵敏度的同时，实现了更高的基因表达灵敏度。

人脑样本分别使用Next GEM Multiome ATAC+Gene Expression和GEM-X Epi Multiome检测试剂进行处理。基因表达数据分析纳入了比对至内含子区域的测序读长。研究采用计算机模拟下采样法，在一系列测序深度下测定了基因表达或ATAC信号的灵敏度。(A)以每个细胞核的中位基因数或中位UM数衡量，GEM-X Epi Multiome的基因表达灵敏度高于Next GEM检测试剂。(B)以高质量的每个细胞核独特片段数衡量，GEM-XEpi Multiome与Next GEM检测试剂的ATAC灵敏度相近。